Mit der Übernahme der Domäne im Jahr 1987 vom Land Hessen wurde mit der Umstellung der Produktionsweise nach organisch-biologischen Grundsätzen begonnen. Am 1. Mai 1992 erhielt die Domäne nach einer fünfjährigen Umstellungsphase die Anerkennung als "Bioland-Betrieb". In den eigenen Hofläden auf der Domäne Mechtildshausen können die Besucher Backwaren, Fleisch und Wurst sowie Milchprodukte erwerben, die in der eigenen Bäckerei, Metzgerei oder Molkerei hergestellt werden. Weitere 1.000 Produkte wie Gemüse, Obst, Säfte, Weine, Kaffee, Öle und noch vieles mehr können die Kunden im "Domänenmarkt" einkaufen. Wer während des Einkaufs Hunger bekommt, kann diesen direkt vor Ort im Café Bohne oder im Restaurant stillen. Zusätzlich besteht die Möglichkeit, Veranstaltungsräume für Tagungen oder Feierlichkeiten zu mieten.